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Monte Carlo3

[Sampling] Markov Chain Monte Carlo (MCMC) (5) - Diagnosis MCMC diagnosis: convergence, correlations, CLT, effective sample size (ESS) MCMC: Pros and Cons(+) high dimensional data에서 잘 동작한다.(+) Metropolis-Hastings 알고리즘과 같이 general-purpose sampler로 확장이 쉽다(+) 구현이 쉬운 편이다(-) sequential한 성질 때문에 대규보 데이터로 확장이 어렵다 (not really scalable)(-) 어떤 chain이 target distribution에 도달하는지 명확하지 않다.(-) 수렴 지표가 명확하지 않다.그렇다면 무엇이 더 좋은 MCMC 알고리즘으로 만들까?좋은 MCMC는, high-density 영역에 오래 머.. 2024. 3. 19.
[Sampling] Markov Chain Monte Carlo (MCMC) (4) - Slice sampling Slice Samplingproposal distribution 없이 $p(x)$ 또는 $\tilde{p}(x)$로부터 직접 샘플링하는 방법이다.일반적으로 univariate multi-modal distribution에 유용하다.(논문저자 Radford M. Neal에 따르면 multivariate의 경우에도 slice sampling을 변형하여 샘플링 할 수 있다. 여기서는 생략) Algorithmslice variable $u$를 도입한다. (책에 따라 auxiliary variable, additional variable이라고도 한다.)\[ p(x,u) = \cfrac{\mathbf {1}_{ \{ 0 \le u \le \tilde{p}(x) \} } }{Z}, \ \int_0^{\tilde{p}.. 2023. 10. 15.
[Sampling] Markov Chain Monte Carlo (MCMC) (3) - Gibbs sampling Gibbs SamplingGibbs sampling은 MCMC 기법 중에서 Metropolis-Hastings 알고리즘의 특수한 형태이다.확률변수가 다음과 같을 때 사용할 수 있다.$x = [x_1, x_2, \dots, x_d]^\top$이고 target distribution이 $p(x)$일 때 다음을 만족하면 Gibbs sampling을 적용할 수 있다.\[ x_i \sim p(x_i | x_1, \dots, x_{i-1}, x_{i+1}, \dots, x_d) \]$x_i$가 $x \setminus x_i$ condition에서 샘플링되는 조건이다.Gibbs sampling algorithm랜덤하게 $x^{(1)}$를 초기화한다.for $t=1, \dots$ do    $x^{(t+1)} = x^.. 2023. 10. 14.
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